Octobre 2022
Reviewer: Dr. med. Herbert Bosshart
Contexte:
Le séquençage à haut débit (HTS) (= terme de la Liste des analyses, également «séquençage de nouvelle génération» ou « séquençage de panel/d’exome» dans la pratique clinique) est de plus en plus utilisé, également pendant la grossesse, après un résultat d’analyse par microarray normal, parce que le diagnostic d’une maladie génétique de fond
Une maladie monogénique est causée par un changement unique (mutation ou variant pathogène) de la séquence d’ADN d’un seul gène. Toutefois, plusieurs maladies monogéniques différentes peuvent produire un tableau clinique identique. Le séquençage à haut débit permet de séquencer plusieurs gènes à la fois, d’identifier ainsi le variant qui est la cause de l’anomalie et de poser le diagnostic.
L’augmentation de la clarté nucale et autres anomalies fœtales visibles à l’échographie prénatale signalent une augmentation du risque de maladie monogénique, notamment si aucune anomalie chromosomique n’a été identifiée comme cause.
Le taux de diagnostic de maladie monogénique par séquençage à haut débit est en moyenne d’environ 30 % dans l’état actuel des connaissances. Le séquençage à haut débit est un examen coûteux. Dans la pratique clinique, on ne peut généralement pas attendre l’acceptation de sa prise en charge alors qu’il faut, si possible, connaître le résultat de l’analyse avant la 24e semaine de grossesse. Dans le même temps, la qualité de l’échographie, l’indication clinique et le conseil génétique à la patiente doivent être garantis, afin que l’analyse ait une valeur d’information maximale et/ou afin d’éviter les examens inutiles ou leurs conséquences néfastes.
En vertu de l’art. 13d de l’OPAS, les méthodes de diagnostic invasives (amniocentèse, prélèvement des villosités choriales...) sont indiquées « pour les femmes enceintes chez lesquelles le résultat de l’échographie, l’anamnèse familiale ou toute autre raison laisse supposer un risque de 1:380 ou plus que le fœtus soit atteint d’une maladie due à des facteurs exclusivement génétiques...»
Ce risque existe, entre autres, quand l’échographie met en évidence des anomalies fœtales. Selon la LA, une analyse par microarray (6107.35) est prise en charge avec la limitation suivante : «Limitation... d. Clarté nucale augmentée (> 95ème percentile) ou autres anomalies fœtales à l’échographie, après exclusion des trisomies classiques sur du matériel fœtal...»
La classification des clartés nucales fœtales en mm dépend de l’âge de la grossesse (pouvoir prédictif normé au premier trimestre entre 11+0 et 13+6 SG, soit de la 12e à la 14e SG) et pour la même longueur crânio-caudale. L’augmentation, et ainsi la comparabilité, est indiquée par les valeurs de percentile (élévation >95e percentile), de la même manière que pour les dimensions corporelles des enfants en pédiatrie, et elle suffit à justifier une demande de prise en charge des coûts.
La prise en charge des coûts d’un séquençage à haut débit prénatal est pertinente dans les circonstances qui suivent et peut être attendue dans l’intérêt de la patiente, si les conditions sont réunies :
Références pertinentes:
International Society for Prenatal Diagnosis Updated Position Statement on the use of genome-wide sequencing for prenatal diagnosis. Van den Veyver IB, Chandler N, Wilkins-Haug LE, Wapner RJ, Chitty LS, ISPD Board of Directors. Prenat Diagn. 2022;42:796-803.
Diagnostic yield of exome sequencing for prenatal diagnosis of fetal structural anomalies: A systematic review and meta-analysis. Mellis R, Oprych K, Scotchman E, Hill M, Chitty LS.Prenat Diagn. 2022 Feb 15. doi: 10.1002/pd.6115. Online ahead of print.
Monaghan KG, Leach NT, Pekarek D, Prasad P, Rose NC; ACMG Professional Practice and Guidelines Committee. The use of fetal exome sequencing in prenatal diagnosis: a points to consider document of the American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG). Genet Med. 2020 Apr;22(4):675-680. doi: 10.1038/s41436-019-0731-7. Epub 2020 Jan 8. PMID: 31911674.
International Society for Prenatal Diagnosis; Society for Maternal and Fetal Medicine; Perinatal Quality Foundation. Joint Position Statement from the International Society for Prenatal Diagnosis (ISPD), the Society for Maternal Fetal Medicine (SMFM), and the Perinatal Quality Foundation (PQF) on the use of genome-wide sequencing for fetal diagnosis. Prenat Diagn. 2018 Jan;38(1):6-9. doi: 10.1002/pd.5195. PMID: 29315690.
Reviewed SGV/SGMG AG 29.09.2022
Isabel Filges, 02.10.2022
Société Suisse des médecins-conseils et médecins d'assurances
Avez-vous des questions, remarques ou suggestions concenant notre Homepage?
Transmettez-les nous et contactez notre bureau, s.v.p.
SGV
c/o MBC Markus Bonelli Consulting
Rudolf Diesel-Strasse 5
8404 Winterthur
Tel. 052 226 06 03
Fax 052 226 06 04
Email info@vertrauensaerzte.ch